在奥特曼格斗进化3中，许多角色都有独特的触发条件。佐菲按照初代、塞文、杰克、艾斯、泰罗的顺序通关战斗模式后出现。阿斯特拉则需要使用雷欧，在战斗中使用ウルトラダブルフラッシャー终结对手，才能见到它。
艾迪的出现条件较为复杂，包括奥特模式下完成A级以上的全任务，所有奥特曼各自完成一次战斗模式和十大据点，但不包括黑暗迪迦、邪恶戴拿和LE GEND。玩具赛文在雷德王复活宣言和激斗！艾迪的两关中，若评级达到A以上，就能见到。
阿古茹需要使用盖亚V2型态，在战斗模式中完成一次通关后才会现身。JUSTICE则是在第16关第一部分中，使用COSMOS击败JUSTICE后才会出现。LEGEND在第16关评级为A以上时才会出现，但无法记录。
达达需要在奥特模式初始任务全部A级以上通关后，与隐藏关怪兽标本一同出现。格莫拉在奥特模式“怪兽殿下”任务中，完成评级为A以上后才出现。
雷德王在奥特模式“怪兽标本”任务中，由雷德王击败初代后出现。贝蒙斯坦同样在“怪兽标本”任务中，由贝蒙斯坦击败初代后出现。
双尾蛋在奥特模式“两大怪兽袭击东京”任务中，完成评级为A以上后出现。巴吉修姆在“怪兽标本”任务中，由巴吉修姆击败初代后出现。
艾斯机器人在奥特模式“死刑！奥特五兄弟”任务中，直接使用艾斯机器人击败艾斯杀手后才会出现。黑暗迪迦和邪恶戴拿在奥特模式“影之继承者”和“死斗！戴拿VS戴拿”中，评级为B以上通关后，在战斗模式中使用时有一定几率遇到，击败后出现。
宇宙正义机器人在双打模式中，使用COSMOS和JUSTICE一起通关一次后才会出现。
至于技能方面，你只需要用不同的奥特曼分别玩一次战斗模式和世界十大据点，同时完成侵略指令，这个奥特曼的技能基本上就全出来了。然后，你可以在装备模式中装备你最喜欢的能力。详情
