妻子拒绝让儿子做亲子鉴定法院应作如下处理：当事人一方向法院起诉请求确认亲子关系，并提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以推定请求确认亲子关系一方的主张成立。
一、上户口需要做亲子鉴定吗?
不一定的，如果有医院给出的出生证明就不用做亲子鉴定，没有的话就需要做亲子鉴定。上户口需要做亲子鉴定的详细情况如下：
1.无出生证。因种种原因，孩子没有在有妇产科资质的医院出生，或没有在医院出生，因而没有规范的出生证，上户口时就需要做亲子鉴定。或已有出生证，但出生证上父母的名字和身份证、户口本上名字不一致，需要亲子鉴定证明。
2.因孩子被拐卖、遗失后又通过各种途径找回，户口需要和亲生父母上到一起，而需要亲子鉴定报告书证明。
3.未婚生育，现有法定证件无法证明孩子的亲生父母关系。
4.弃儿回家上户。孩子被抱养出去，又需领养回来，或因躲避计划生育，孩子户口上在他人名下需要转到亲生父母名下，需要做亲子鉴定。
5.部门特殊规定，因某些部门在招工、招干时，因怕其他行业人员进入特殊行业，在招工招干时需要本行业父母和孩子做亲子关系证明。
6.领养的孩子上户，需要证明孩子与养父母并非亲生关系。
二、婚后发现孩子不是亲生的怎么办
对于亲子关系有异议，并且有正当理由的，父亲或者母亲可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。因此婚后发现孩子不是亲生的，可以去医院做亲子鉴定，然后拿着亲子鉴定，去人民法院请求亲子关系不存在的，也可以不去人民法院请求亲子关系不存在，只要对孩子履行了抚养教育的义务，孩子在法律上需要承担孩子对父母的义务。
三、怎样向法院申请合同无效
一般都是当事人保留合同、证据等，去申请确认。在法院作出合同无效的认定之前，该合同应该是有效的。除非合同必然无效，法官一般推定有效。只有当当事人一方向法院提出认定合同无效的请求或主张时，法院才能确认合同无效。
收集对方以欺诈、胁迫的方法让自己签合同的证据，或者是该合同违法的证据，向法院起诉即可。一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益的，订立的合同无效。
【本文关联的相关法律依据】
《最高人民法院关于适用婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条
父或者母向人民法院起诉请求否认亲子关系，并已提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定否认亲子关系一方的主张成立。
父或者母以及成年子女起诉请求确认亲子关系，并提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定确认亲子关系一方的主张成立。