工伤二次手术报销流程为把相关材料送至市社会保险中心工伤科进行备案盖章进行报销。
第二次手术如果是工伤事故引发的，或者是属于后期的遗留问题，那么也是可以认定为工伤事故，并享受工伤待遇的，具体情况下可以由工伤鉴定部门来进行鉴定处理，避免法律适用错误。申请劳动能力鉴定的用人单位、工伤人员或者其直系亲属对劳动能力鉴定结论或者鉴定结论不服的，可以在收到该鉴定结论之日起15日内向市鉴定委员会提出再次鉴定申请。
工伤索赔的赔偿项目有以下几种情况：
1、造成一般伤害(未达到残疾)的赔偿项目
医疗费、伤者住院期间的伙食补助费、生活护理费、工伤期间的工资、交通食宿费。
2、造成伤残的赔偿项目：
医疗费、伤者住院期间的伙食补助费、生活护理费、工伤期间的工资、交通食宿费、辅助器具费、一次性伤残补助金、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金。
3、造成死亡的赔偿项目：
丧葬补助金、一次性伤亡补助金、供养亲属抚恤金。
法律依据：
《工伤保险条例》 第三十条
职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。
治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准，由国务院社会保险行政部门会同国务院卫生行政部门、食品药品监督管理部门等部门规定。
工伤第一次手术完做第二次应该怎么报销？把相关材料送至社会保险中心工伤科进行备案即可。