甲基蓝的作用很多，可作为染色剂、消毒剂、以及在日常生活中使用范围最广的是为小鱼杀菌治病，以下是甲基蓝的具体作用：
1.甲基蓝是一种化学物质，具有染色剂的作用，根据其身的化学特性，可以在特定的情况下进行染色，主要用于化学研制。
2.在饲养小鱼时，如果鱼儿生病了，也可以用甲基蓝给鱼儿治病，当鱼缸内的小鱼互相感染生病后，在鱼缸内加入甲基蓝溶液，治疗小鱼之间的互相感染。或者在鱼缸内倒入甲基蓝溶液，也能起到杀菌的作用，在初买小鱼想要进行饲养时，可以先用甲基蓝在鱼缸内消毒，然后再将小鱼放到鱼缸内，这样环境没有细菌，干净又卫生。
3.同时甲基蓝也具有杀菌消毒的作用，在医学方面也用途广泛，在医学方面作为消毒剂为许多医疗器械消毒，消灭细菌等。