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质粒大抽

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质粒大抽protocol(用QIAGEN Maxi Column)

1. 从转染的细菌平板中挑取中等大小,饱满,而且没有和其他克隆接触的单克隆,接种到 3ml选择性培养基,摇床培养14小时,225 rpm。

2. 从小量培养物中取1ml用作小量抽提,并且用小量抽提产物酶切鉴定,选取阳性克隆的 培养物,以1:1000接种到100 ml选择性LB培养基中,摇床培养14小时,225 rpm。

3. 从大量培养物中取700微升菌液和300微升甘油(灭菌)加入冻存管,放入液氮中,过 夜后,放入-70℃冰箱中。并且在stocklist中加入菌种的详细信息(stocklist 贴在冻存管的上方)。

4. 把100ml的菌液倒进250ml离心管中,4℃离心,6000g离心15分钟(No41 rotor 8500 rpm)。

5. 倒掉上清,并倒扣在吸水纸上片刻.然后加入4ml 4℃预冷的细胞重悬液buffer P1(确 定是否加了RNase),反复吹打沉淀至没有悬浮的菌块。然后将悬浮液转到50ml的离心管中。

6. 加入4ml细胞裂解液 buffer P2,彻底而且轻柔地颠倒混匀4-6次,在室温下孵育不要超 过5分钟(从开始加P2时计时,时间太长会使质粒DNA断裂)。样品不要斡旋,buffer P2用毕也要及时盖好盖子,以免被空气中的CO2酸化。

7. 加入4ml 预冷的PH调节液buffer P3, 及时地而且轻柔(避免局部十二烷基磺酸钾沉淀) 地颠倒混匀4-6次,在冰上孵育15分钟。后再一次混匀样品.20000g,4℃离

心30分钟(N046 rotor 18000 rpm).若上清不够清需再离心15min. 此步可对上清取样240ul(sample 1)以备检测分析

8. 在层析柱的顶端加四层纱布,并且用buffer QBT润湿纱布。用4ml的buffer QBT来平衡层析柱,让液体自由的流下(尽量将润湿面积减到最小)。(正常情况8min可以流完)

9. 然后把7中的上清小心吸到层析柱中(不可将沉淀绕动),让液体自由流下。此步可取 样240ul(sample 2)以备检测分析

10. 用5ml buffer QC清洗层析柱一次,去掉纱布(去掉前,建议戴一次性手套挤一挤或用 头挤一挤),再加一次5ml buffer QC清洗层析柱。此步可取样400ul(sample 3)以备检测分析

11. 用8-10ml buffer QF洗脱DNA,用两只10ml的离心管分别收集洗脱液。此步可取样20ul (sample 4)以备检测分析;同时可再加5ml buffer QF洗柱,洗柱液保存至实验结束(sample 5)以备检测分析,接着按清洗方案洗柱。

12. 在两管洗脱液中各加入0.7倍(5×0.7=3.5 ml)体积的室温的异丙醇沉淀DNA,并在沉淀会 出现的位置做标记,离心前一定要蜗旋(vortex 8.5) 然后在4℃,15000g离心30分钟(No26 rotor 14300 rpm),取出时保持管平行移动,小心的倒去上清.注意:不要将沉淀倒掉.

13. 用2ml 室温的70%乙醇清洗沉淀(清洗沉淀盐及置换异丙醇), 4℃,15000g离心10分钟 (No26 rotor 14300rpm), 取出时保持管平行移动,小心倒掉上清. 注意:不要将

沉淀倒掉.更高要求时可再一次用乙醇清洗.

14. 在空气中干燥沉淀5-10分钟,用合适体积的TE(一般500ul)溶解沉淀.

附: 大抽用层析柱清洗方案

原则是按照使用时加液的相反顺序加液清洗。

1. 加QF 5ml让液体自由流下,此步要用无菌的10ml离心管收集,待取样检测。

2. 加QC 10 ml 让液体自由流下,重复一次

3. 加QBT 5ml

4. 重复 1,2,3,4步 一次

5. 清洗完毕后加放进50ml离心管中,盖好盖子保存 并在管上和柱子上表明质粒名称,使用次数(以写‘正’的方式标示)

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