您好,欢迎来到筏尚旅游网。
搜索
您的当前位置:首页泌尿系结石患者手术方式的选择:“临床信息+CT特征”的预测效能

泌尿系结石患者手术方式的选择:“临床信息+CT特征”的预测效能

来源:筏尚旅游网
放射学实践2017年11月第32卷第11期垦 —ol Practice,Nov 20—17,Vo1 32,No.11 1183 腹部影像学 特征’’的预测 效能 泌尿系结石患者手术方式的选择 :“临床信息+CT 吴静云,米悦,刘义,马帅,李作峰,施雅慧,李俊博,魏娟,王霄英 【摘要】 目的:探讨泌尿系结石手术前的临床信息(症状、体征等)和CT报告与手术方式的相关性。方法:选取因泌 尿系结石住院治疗的患者的病例资料,导出有完整术前资料的患者文档,以自然语言处理(NLP)技术对文档进行分析,提 取加工其中的关键信息,研究术前关键信息与手术方式的相关性。结果:收集连续患者资料371例,行输尿镜碎石术 (URL)患者190例,行经皮肾镜碎石取石术(PNL)患者142例,行输尿管软镜碎石术(RIRS)患者39例。利用NLP比较 临床信息、CT报告与手术方式的相关性,单纯“CT报告”分类符合率为0.456,ROC曲线下面积为0.608;“CT报告+临 床信息”分类符合率为0.461,ROC曲线下面积为0.618。增加临床信息后,NLP模型的分类符合率未见明显变化,但决 策树路径变长,节点变多,规则复杂,不利于临床使用。结论:对于拟行手术的泌尿系结石患者,手术前的CT报告与手术 方式具有相关性,可为手术方式的临床决策提供直接有效的信息。增加症状和体征的临床信息,不能提高预测手术方式 的符合率。 【关键词】 自然语言处理;临床决策;泌尿系统结石;影像信息学 【中图分类号】R814.42;R693.4【文献标识码】A【文章编号】1000—0313(2017)11—1183—04 D0I:1O.136O9/j.cnki.1000—0313.2O17.11.018 Correlation between clinical information,CT signs and surgical procedures of urinary calculus:natural language processing re— search wU Jing—yun,MI Yue,LIU Yi,et a1.Department of Radiology,Peking University First Hospital,Beijing 100034, China [Abstract]Objective:To explore the value of clinical information(symptom ̄sign)and CT findings of urinary calcu— lus in clinical decision—making of surgical procedures.Methods:Medical recording documents were retr0spective1y archived from HIS for patients who had CT examination for urinary calculus and surgical procedures in the hospita1.By using differ— ent types of NLP model,all the imaging and clinical data were extracted and processed for searching the descriptors of CT features,symptoms and signs.The correlation of the descriptors with surgical methods was studied.Results:3 7 1 consecutive data were collected(142 percutaneous nephrolithotripsy,190 ureteroscopie lithotripsy,and 39 retrograde intrarena1 surgery, respectively).The precision of”CT report”was 0.456(AUC 0.608).The precision of”CT report+clinical information” was 0.464(AUC 0.618).With additional information of clinical data,the classification accuracy of NLP was not improved, but leading to longer path of decision tree,more nodes and more complex rules.Conclusion:The content of CT report can provide direct and effective information for clinical decision—making of surgical procedure. [Key words] Natural language processing;Clinical decision making;Urinary calculus;Imaging informatics 泌尿系结石是泌尿系统的常见病和多发病,在结 石患者就诊过程中,通常在先有临床症状(以血尿、腹 痛为主),有时可有查体的阳性发现,在此基础上行 CT检查可做出结石的确定诊断,同时提供指导治疗 1.研究对象 材料与方法 选取住院病例系统中诊断为“泌尿系结石”、并行 手术治疗的连续病例,均有完整的症状、体征、CT报 告资料。将上述资料导出为Excel文件,存储并汇总 后进行NI P分析。 2.NI P分析 的信息口]。本研究按照泌尿系结石患者最终进行的手 术方式进行分类,利用自然语言处理(natural lan— guage processing,NLP)决策树方法来探究患者的临 床信息(症状、体征)和CT报告内容与手术方式的相 关性,研究各种信息在临床医生决策过程中的价值。 首先进行文档预处理,手工修正有错误、缺失信息 的数据,对不能用于分析的文档删除,形成rawtext 作者单位:100034北京,北京大学第一医院医学影像科(吴静云、 刘义、马帅、王霄英),泌尿外科(米悦);200233上海,飞利浦中国研究 院(李作峰、施雅慧、李俊博、魏娟) 作者简介:吴静云(1985一),女,广西桂林人,博士,主治医师,主要 从事。肾脏功能MR成像、对比剂研究及医学数据库研究。 通讯作者:王霄英,E mail:cj r_wangxiaoying@vip.163.corn 格式。 然后进行CT特征的提取和加工,分词、形成向 量,统计词频、以高频词汇构建特征向量,进行语义分 析,最终得到描述CT特征的关键词。 放射学实践201 7年11月第32卷第11期Radiol Practice,Nov 201 7,Vo1 32,No.11 再进行临床信息的提取和加工,从出院小结中删 除包含最终手术方案部分的描述,利用正则表达式识 痛、血尿,偶伴恶心、睾丸疼痛、膀胱刺激症状E 等,不 仅影响患者生活质量 而且其引起的泌尿系梗阻可危 害肾功能甚至继发严重感染。多排螺旋CT检查是泌 别“人院后”“行XX术”等关键词,将“出院小结”部分 拆分成手术前临床信息描述部分和手术方案部分。手 术方案部分的描述不进人词袋模型的构建过程。 尿系结石首选的影像检查方法,可清晰显示结石数量、 位置、大小、CT值、与周围组织的关系及肾积水情况 patterns—Eu [ 。;]*收入我[科室院]([一。;]) , u'E 。;]*[/d~]+[ ,。前。,]+术[ 后] ,u [ 。;]*人 院后 ,u [ 。;]*完善 {,3}检查 ,u [ 。;]*检查基本 完善 ,u [ 。;]*手术.{,5)顺利 ,u [ 。;]*行[ 、,。]+ 等,增强CT还可进一步评价’肾脏功能。所以CT既 有确诊结石的作用,又有指导结石治疗的价值E 。目 前结石治疗以微创腔内手术为主,临床医生选择手式 方式时,需综合考虑患者的全身状况和结石具体情 况E 。 术,] 一 t 对上述拆分出的CT报告内容和临床信息构建 ngram信息,用于决策树的构建与评价。 3.统计学方法 本研究利用NLP技术,探索使用基于决策树的数 据挖掘技术是否可对临床手术决策起到提示作用。前 期本团队已初步验证了NLP可提取CT报告中的关 键特征,与专家提取的关键特征具有可比性。另外, NLP提取的特征,在经过优化后可模拟临床医生的决 以十折交叉验证方法验证仅用“CT报告”、“CT 报告+临床信息”时,NI P模型预测手术方案的分类 符合率。 结 果 策,CT报告中结石、炎症和输尿管形态的描述与手术 方式的选择有一定的相关性。在以上前期工作的基础 上,本研究试图探索增加临床信息后,可否进一步提高 NLP对手术方式的预测效能。但结果显示,增加临床 信息不能提高对手术方式的预测符合率,考虑其原因, 可能有以下两个方面: 371例患者的连续资料人组,其中行输尿镜碎石 术(ureteroscopic lithotripsy,URL)190例,行经皮肾 镜碎石取石术(percutaneous nephrolithotripsy,PNL) 142例,行输尿管软镜碎石术(retrograde intrarenal surgery,RIRS)39例。 ①增加临床信息后,NLP的数据质量下降,降低 了决策效能。本研究对比了“CT报告”、“CT报告+ 从“CT报告+临床信息”中提取的信息,构建决 策树见图1。 比较“CT报告”、“CT+临床信息”NLP的验证结 果(表1)。从表1所示的具体评价指标可以看出,仅 用“CT报告”的模型对各个分类的识别性能与“CT报 临床信息”对临床决策的价值,结果显示单纯使用“CT 报告”决策符合率为0.456,使用“CT报告+临床信 息”符合率为0.461。十折交叉验证结果显示,两种模 型对各个分类的识别性能相近,只在数字上有细微的 差异。从模型结构分析中可以看出,使用临床信息时 的决策树决策路径更长,节点更多,规则更加复杂。将 CT报告、临床信息两部分内容整合之后,由于报告内 容的具体表述不完全一致,导致词频矩阵更加稀疏,使 得模型的预测能力有所降低。因此,仅CT报告中的 告+临床信息”相似。在已有CT报告的基础上,增加 临床信息对于手术方案的决策并未提供更多的帮助, 但此时的决策树路径更长,节点多,规则复杂。从实际 工作的角度考虑,与“CT报告+临床信息”比较,仅使 用“CT报告”中的内容对于决策提供的信息更加直接 有效,相比之下决策树更小、决策路径更短。 表1不同NLP模型决策树的验证结果 内容可为临床决策提供更加直接有效的信息,且决策 树计算规则相对简化。 ②临床信息的实际价值主要在入院选择和预后评 估,而对手术方式的选择价值明显低于CT信息。在 常规实际工作中,泌尿系结石治疗决策的制定需要考 虑到患者的所有信息例如患者的基础疾病、目前的临 床症状和体征等临床信息、泌尿系统的解剖结构、结石 的影像征象、患者的诉求等复杂因素,最终由医患双方 协商决定。但临床医生做出决策时,各部分信息的权 重并不相同。本研究收集的病例均为住院手术的结石 患者,这些患者术前已排除了手术禁忌症,例如全身感 染、发热等,即已经决定选择手术治疗了。那么进一步 讨 论 确定手术方案时,则主要依靠CT征象。CT的诊断价 值首先是除外非结石性的血尿病因,特别是肿瘤性病 泌尿系结石的常见临床表现为:腰腹部绞痛、胀 放射学实践2017年11 第32卷箜 塑垦 ! 望! !! ! : 1185 裂 结石 0 ; 亍 超声 0 f ; (孵结石. 甜abe》) 0 ; (f]谚,誊 潞渌系 e 《 0 ; } { { 瀚瘴管 内 来觅异常》(章0 {{ { 疆 来)(稿1 { l } ; 伏小 形蕊,柬兜异常 <盘0 };;{{i;(肾 体歌 增太) 0 ;{l;{{{{ 甜4hle) 椎葡,困) O i l { : l j{瀚熙管 悫行)妇0 {{j i! { {{ {《S.# ̄value>.觅,一)《蕾0 f}{l} i i{{(出现 衰触鼹鄱, 0 i { { j } ; ! ; { } } }(发,臀 下 盏 内》(蕾0 ;i i};{}{;}{}}(弩科 检查)如0 { {  ;} ; i { (肾盏,内 呵霓 裳)0 0 l } 伏小 纳 簪《v曲 》 吩 0 ! { l l } } } { ; t { ; l i i } } { i { j { { { { j { } i { { ; (肾盏 输慰管,辖禽毫 ;{i;{{l{;i; { }i i(未,觅 增> 0 1 {  {o { l { i { i (痿发 赢密壤 跹》 0  }l { { { ; } { j } l l i } l } (肾盏 输屎管,淫接) 0 le) 觉,一 囊) 巷 {{}{{{{l l{{{;l l l{{ ; l ; { } i  i! { { l { i } { { { j 册脏 怫 柬觅异繁》 0:2(S304,:S 56) f ; j } } { { { } |脏 多卜形 米觉捧常》)0 j f { ; } } } { f { } i } ; l } i l } i i i ; { l l } l {瀚 鲸管 缠葛) 0:I c3。13) ; l ; l ; l } l { i } } i j { i l l l ; { 瀚艨麓 结 i)》 2 55国 86》 {}  { { { { } } } { i ; { ; { { { { {( ̄<value>,可霓 一 褰)》 1024/o 6  i; { { j l  {{ } } } { l { } } 《臀盖,输屎营 逡攘)》O:1壮t9 134) j ;  i{ ; { ; { } l { } { l ; } } (多发 赢密陵 灶))O:1(4.77/134) { } l } l { { i } { } } l l (朱。觅 螬)》O:1 AStI34) i { }(背孟,输保管 辖畲都 0:1(4 I/0.67) I、|约, 甜a x))O:I(4 1A).67) 翌 内 觅 多裳)>D:10.95 ̄0-67) f l { ; } } { f ; { { { l } { j l } i i { i } } } i ; j } } } { } } i l { ; i { ; { { i l { (专科 检查p0:1 95/0 秘 ; { l } i i { ! } i ; { 落 瞥 下 盏,内))o:1《5.14) : } } i { } l ; { { { 《出税 左捌 膜鄯)> !礴湛 l { l } l } { { i(Se vakle>,见 一)》0 {{  l l } { ! { l { 盛h cm)如4:2移 01) {}i;{{};}{; 山e> ㈣》4:if2 93》 }{}{{}{{} 管 建纾))0  ll i } } l { { l { (占位 征象)《 1:2lc4.88∞ S6) ; { ; { } { l i {}l l ll ; ; { { { { {{ i ; } } 《占t荛,征象)>l:3 ss) { } 蛳 年前 因)>0 l;{ 《v幽秘 天藕)和o=1(3。43) i ; ;( ̄<vabae> 天蔚)>O:3 93)  {l { { { { (肾 体积 增大)》0 } i { l l {  iI 《Ct汞)《盘 2 c2.6S) i ! { } } ; (cTo暴))O:3 8∞ { l {e赶小 形悫 束蹙异鬻)》识;(7 l9 l ;4, }{ l l} 漕强 来))1:3(6 52/0.67) { ; { 瀚屎管 内,来觅异鬻)》0:3 .71:0 86) } } i ff]诊,燕 潞菲茉 CT)》O:3(1O 12/1 34) { { 《霹结石,# ah 》0 i } { 河霓 多发,教密) 0 {{{l 喘 a mmH静 岳 }{ }}i(S ̄<value>,可觅) 0 };}}{l(侧 嚣丸≥ 0 }}{}}{{(内 瓣脏) 0 { { ; ! { { ; ; { }0b求,避一步) O { } } f肾盏 扩张》 0:3(47 3 9l》 { { } l { { } ! { { 值盏 扩张))0  i! 甜4hIe),月象 箭)《毫0:1 81.'0.67) } } i { { { } ; l(e<value>,愚寨,翦))。:3 85) ; ! ; ; i l } f蜘求 避一涉 0:1(2 5々) i{ } { { } } (内,群脏))O:1 +l,O 67) l}{{ {(《融,霉丸))0:t0-2 ̄) f } } f ;(S ̄.<vahe>o霹觅)》O:1 ."》 { ; l 转☆ ram ̄>O:1《8.3R,0.67) ; } ; 河觉 多裳 教密))e:I(3.05:1 34) 穗千 怒声 >O:3(13露5/1 34) 滞篷 结爵))O:1《13。52.4) 67) ① 图1 “CT+临床信息”的决策树。 变 。 ;其次是描述结石的关键特征,大多数情况下这些 关键特征是选择术式的主要依据 。本研究以NLP 的客观数据,提出了术式选择过程以CT信息为主、增 日常临床工作决策过程中可能的规律,当然这一推论 尚需大量实验反复验证。实际上,在疾病的诊治过程 中,这种情况并不少见,如:疾病影像诊断明确,以微创 术式为主,手术整体难度不大、手术对患者全身情况要 加临床信息不改变术式选择的推论,揭示了本疾病在 放射学实践2017年l1月第32卷第11期Radiol Practice,Nov 20l7,Vol 32,No.11 求不高时,病灶的局部信息对术式的选择更重要 ]。 需注意的是,手术方式的选择仅是结石患者诊治全过 程中的一个环节,临床信息在其他环节的决策应有重 要价值,今后应进一步研究。 “CT报告+临床信息”有望用于区分门诊与住院 治疗。上尿路结石是泌尿外科常见疾病,治疗方案较 多,常用治疗方案包括保守治疗、药物治疗、体外冲击 波碎石、输尿管镜取石术、经皮。肾镜取石术及开放手 术。随着微创术式的普及,泌尿外科医师在结石治疗 时面临多重选择。治疗前根据影像资料准确判断结石 的相关信息,可以帮助临床医生制定更加详实可靠的 治疗方案 j。泌尿系CT报告可以提供结石的位置、 大小、成分等信息,有利于临床优化现有的治疗方案, 制定一个标准的诊断治疗流程。但CT报告中不能反 映患者的病史、全身情况,而这些对选择治疗方案也是 非常重要的[] 。]。最近人工研究的结果已显示,因急性 肾绞痛就诊的患者,CT报告结石较大、密度较高、位 题 参 .、 j ] ] ] ] 卜l _] ] 口 ) 1 于近端的,合并寒战、发热和白细胞升高的患者预测其 行有创治疗的可能性较高口 。所以,将来可使用大量 数据,以NLP研究“CT报告+临床信息”对选择人院 手术治疗的患者是否具有指导作用。 “CT报告+临床信息”有望用于评价结石的复发 和预后。结石形成的危险因素主要有代谢异常、尿路 梗阻、感染、异物等局部因素以及引起结石的药物因 素。结石成因可以用于评估治疗方案及预后,它影响 结石的复发几率口 。泌尿系结石的常见成分为含钙 结石、磷酸镁铵结石(鸟粪石)、尿酸结石及胱氨酸结 石,通常是混合成分结石,双能量CT可分析结石成 分口 。所以,将来可以NI P研究“CT报告+临床信 息+随访信息”,对患者的术后并发症、结石复发和预 后做出评估 J。目前已有研究已证明,影像资料对患 者的预后有明确的提示作用 ,与临床资料结合,形 成“影像组学(radiomics)”、“影像基因组学(radiog— enomics)”数据 。J,是一种重要的影像信息学研究方 法,用于预后评价的作用已经获得一些证据的支持,是 影像与临床信息整合的重要价值之一。 本研究的结果虽然没有接受最初的研究假设,增 加临床信息后未能提高CT对手术方式的预测效能, 但其提示意义仍然非常重要:在影像信息学研究过程 中,首先应定义明确的任务,其次应以高质量的数据进 行研究,最后IT研究人员应与医务人员紧密合作,充 分挖掘有效数据,才能为临床决策提供有力的帮助。 更加重要的是,疾病的种类千差万别,即使是同一种疾 病在不同的决策阶段,各类信息的辅助决策价值也是 不同的。所以,临床医学中的信息化进程不可能一蹴 而就,研究者必须有足够的耐心,细致地逐个解决问 2

因篇幅问题不能全部显示,请点此查看更多更全内容

Copyright © 2019- efsc.cn 版权所有

违法及侵权请联系:TEL:199 1889 7713 E-MAIL:2724546146@qq.com

本站由北京市万商天勤律师事务所王兴未律师提供法律服务